Illumina终于拥有了自己的单细胞产品!

$Illumina(ILMN)$ 发布消息称,已完成对单细胞公司Fluent BioSciences的收购。(资金来源为公司现金,所以大概率不会是特别大的金额。)

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通过这项收购,Illumina终于拥有了自己的单细胞产品!(Illumina之前曾与Bio-Rad联合开发单细胞产品和解决方案,但推广和商业化并不是很理想。)

单细胞生物学,特别是单细胞转录组学scRNA-Seq,提供了前所未有的洞察力,正在迅速渗透生物学研究。此外,高通量药物筛选、复杂 CRISPR 筛选和复杂组织中稀有细胞检测等转化应用也需要简单、多功能、高度可扩展且经济高效的 scRNA-seq 工具。

目前可用的 scRNA-seq 方法还是有一些不完美的地方,比如基于液滴的应用 $10x Genomics, Inc.(TXG)$ 每次只产生一个液滴,这限制了通量,并且依赖于复杂且昂贵的仪器;而基于纳米孔阵列的方法受表面积限制,因此需要这种定制的耗材,常用的组合条形码可实现高通量转录,但操作流程长,是一个劳动密集型的工作。

Illumina这次收购的Fluent Bio与上述的方法都不一样,提示了下一代单细胞测序方法可以是无微流体的。Fluent开发了一种使用粒子模板乳化而不是微流体的技术,可以在几分钟内处理数百万个细胞。

对于单细胞测序研究来说,使用商业液滴微流控平台的细胞条形码价格可能已经超过了NGS本身。为了跟上NGS的进步,需要新的细胞条形码技术来扩展到数百万个细胞和数百个实验条件。

Fluent开发的这种单细胞系统,具有基于珠子的条形码的优点,但不需要微流体,其称之为粒子模板即时分区测序 (PIP-seq),通过涡旋进行批量乳化,这大大提高了单细胞生成的速度、可扩展性和易用性。

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PIP-seq 使用依赖均匀珠子“模板”形成均匀液滴的技术,可在几分钟内将数百万个细胞或数百个样品封装在单分散液滴中。使用微流体通道实现相同的结果需要数小时。通过对 100,000 多个细胞进行单管反应,他们验证了 96 孔板、384 孔板和 1,536 孔板的可扩展性。而PIP-seq 与10x Genomics V3等平台进行比较,也提示了特定细胞类型的基因表达具有极好的一致性。

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PIP-seq 将单细胞分析的瓶颈转回到测序成本上。随着测序成本的持续下降,设想了一个百万细胞时代,其中包含常规的全基因组 Perturb-seq 实验;十亿细胞图集的生成;以及癌症、感染和其他疾病的临床监测。Fluent这种单细胞测序方法与基于板的自动化的兼容性将促进core lab核心设施和行业研究中的大规模筛选和药物研究。同时,减少单细胞 RNA 测序的障碍可能使以前买不起微流控设备或受微流控限制的实验室出现新的应用。

Illumina称Fluent的独特技术与其领先的测序和信息学解决方案(包括可进行单细胞多组学分析的Partek Flow)相结合,将为客户提供完整的解决方案和单点支持。公司计划以Fluent BioSciences的技术为基础,开发完整的端到端单细胞分析解决方案。

当然,Illumina称自己仍将是一个开放的NGS平台,将继续发展测序生态系统,支持单细胞分析等最佳多组学解决方案,并致力于维护和支持现有的单细胞合作伙伴关系。

回到之前的文章话题,这年头,上游测序提供商既要保持开放,又要提供自己的产品和解决方案了。

通过收购 Fluent Bio,Illumina显然正在扩大其在多组学市场的覆盖范围。他们与 Somalogic(LAB 的一部分)合作开发的蛋白组学产品已经开启早期试用。这次又直接进入到了单细胞领域,相信不久之后就会看到Illumina在空间组学上自己的解决方案(或许是通过收购,但这似乎并不比自己开发来得更容易)。

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