对基因测序的初步了解以及龙头股ilmn、pacb的比较

Moonlight
2015-12-07

最近看了一些基因测序行业的资料。其实对于这一行完全是门外汉,并无班门弄斧之意,只是想整理一下,算是对这一行业初步的了解,以便日后跟踪相关股票。也发现有一些朋友开始关注这方面,希望与大家共同交流。

行业

基因测序企业大家觉得是一种什么企业呢?首先不能将它当做一个简单的设备商传统企业。其次也不是那些传统的跨国医药企业。华大老总汪建曾说:此类企业都是大数据企业,可以与研究型医院合作中,在大量的临床检测服务的基础上,收集疾病基因信息,进而形成足够样本大数据化,形成企业核心优势。

意义

基于基因测序技术而开发的各类靶向疗法药物,能够专门对存在特定病症相关基因变异的细胞发动攻击。另外个体可以通过检测基因可以预知自己的未来健康状况,帮助人们从被动预防治疗变为主动预知健康。

市场格局

目前来看基因测序领域是一超多强的局面,ILMN凭借其成熟的二代测序设备牢牢把持住基因测序产业中上游龙头的地位。基因测序作为精准医疗,基因工程以及转基因研究中的重要一环,预计市场未来很长一段时间内依旧会保持快速增长(机构预计2018年将达到117亿美元,复合增长率为21.1%)对于测序平台的期望也会因侧重点不同产生分化。如普通科研院所目前基础性研究对于精度方面的要求较高,对于速度以及高通量不是很关注。而医学研究机构对于测序速度会较为敏感。市场需求增加以及细分会带来更多的机遇。目前由于生物技术的特殊性,造成上游基因测序设备耗材供应商的技术门槛较高,基本上为几家明星企业所垄断。关键技术仍长期掌握在以Illumina为代表的基因测序设备及试剂耗材生产商手上,专利壁垒非常坚固。

评价标准

测序成本,读长(测序得到的读段“reads”长度),和通量是评估测序技术先进与否的三个重要指标。

简单比较

Ilmn为二代基因测序技术,pacb为三代基因测序技术。

pacb测序周期较illumina短。(illumina为周级别,pacb可做到小时级别)

PB的成本不便宜,原因是通量不够高。illumina目前能和PB比的是成本。

PB的几次升级是在读长和通量上进行了升级,但单分子准确率提升有限,(测序错误率高可以说是单分子测序技术的通病。)

pacb的优势是错误是随机的(比如此前发布的纳米孔测序仪)。同时可以通过简单的增加测序深度来做校正。illumina的错误都不随机,所以不能通过简单的增加测序深度来做校正。

整体看

第三代测序技术是为了解决第二代所存在的缺点而开发的,它的根本特点是单分子测序,不需要任何PCR的过程,这是为了能有效避免因PCR偏向性而导致的系统错误,同时提高读长,并要保持二代技术的高通量,低成本的优点。

$(ilmn)$  $(pacb)$

 

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精彩评论

  • 猫尔摩斯
    2015-12-07
    猫尔摩斯
    基因测序就是一超多强没错啊,所以坚决站在ilmn这边。
  • 番茄豆浆
    2015-12-08
    番茄豆浆
    跨度太大  看不懂啊
  • Tony特别帅
    2015-12-07
    Tony特别帅
    相信楼主尽力了,然而还是没有看懂
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